Kurzanleitung Eingabe SEEK

Allgemeine Strukturierung in SEEK

Übersicht der Ressourcen

ISA Seek Struktur

Mögliche Vernetzungen

  Programme Project Investigation Study Assay Publication Data Document
Programme - n (ed)            
Project 1 (mg) -            
Investigation   n (mg) -     n (ed)    
Study     1 (ed) -   n (ed)    
Assay       1 (ed) - 1 (ed) 1 (ed) 1 (ed)
Publication   1 (ed) 1 (ed) 1 (ed) 1 (ed) - 1 (ed)  
Data             -  
Document   n (mg)     n (ed)     -

Beispiel: Eine Investigation kann n (also vielen) Projekte zugewiesen werden. Immer über „Edit“ (=ed), “Manage” (=mg)

Beispiel: Eingabe der Studie ABC

Idee: Sponsor./Programme ist UL. Die Projektebene bündelt alle Personen des Forschungsvorhaben (PI und alle die auch Zugriff bekommen sollen). U.U. gilt diese für mehrere Vorhaben.

Ziel

  • Programm: University Leipzig (Sponsor)
    • Project ABC-PI
      • Investigation ABC
        • Study ABC-Pilot
        • Study ABC
          • Assay: Studienunterlagen
            • Document: Studienprotokoll
            • Document: Einwilligung
          • Assay: Daten (Beschreibung)
            • Datafile Endpunkte 1
            • Datafile Tabelle 2
        • Study ABC-Follow Up
    • Publikation “Discontinuation…”

In SEEK soll sich für die Investigation folgendes Bild ergeben:

Seek Tree Study Tree

Klickanleitung

Es gibt viele Wege zum Ziel. Ressourcen können aus anderen Ressourcen heraus oder eben direkt von der Startseite aus angelegt werden.

  • Einloggen / Startseite
  • Programm anlegen:
    • Create Programm
    • Title z.B. „University Leipzig (Sponsor)
    • Muss, je nach SEEK Konfiguration, genehmigt werden
  • Projekt anlegen:
    • In der Programm-Ansicht „Actions/Create Project“
    • Muss, je nach SEEK Konfiguration, genehmigt werden“
    • Hier sollte man dann als „Project administrators“ sichtbar sein
  • Investigation anlegen:
    • In der Projektansicht “Add new/Add new Investigation”
    • Bei „Projects“ sollte „ABC-PI“ gewählt sein
    • Hinweis, wenn die Investigation unsichtbar ist.
  • Study anlegen:
    • In der Investigationsansicht „Add new/Add new Study“
  • Assay anlegen:
    • In der Studyansicht „A Modellling analysis“ (oder oder An Experimental assay“)
  • Document anlegen:
    • In der Assay Ansicht „Add new/Add new Document”
    • Hier nochmal kontrollieren: Projects “ABC-PI“ auswählen
    • Z.B. lokale PDF „Datei auswählen“
  • DataFile anlgen:
    • Typisch Local File (Excel) hochladen; alle Angaben füllen, insbesondere Projektassoziation
  • Publication anlegen:
    • Z.b. von Titelseite „Create Publication”
    • 3 Möglichkeiten: (von Pubmed, Manuelle Eingabe, aus Literatureintrag)
    • Best Practice: Eingabe über pubmed-id, z.B. 34540953 
    • Zugehöriges Projekt assoziieren, z.B. „ABC-PI“
    • „Fetch“ und „Register“
    • Evtl. Autoren mit SEEK Nutzer assoziieren oder auch, zusätzlich zum Projekt, mit beliebig anderen Ressourcetypen verbinden, z.B. der Investigation „ABC“
    • Nun erst „Save“

      Mögliche Ansicht des Ergebnis

  • Projektansicht „ABC-PI“
    • Hier Related Items oder „Single Page”
  • Aus Investigationansicht
    • Entweder Related Items oder kleine Grafik

    • View Investigation

Feintuning

  • Titel ist Pflicht – aber bitte auch immer Description befüllen!
  • Festlegen der Rechte
  • Best-Practice: Nur Assays evtl. nicht sichtbar; alles andere Public View

Rechte

  • Programme, Projekte und Publikationen sind immer öffentlich sichtbar
  • Test z.B. über Ansicht ohne Anmeldung
  • Investigation, Studies, Assays, Data files, Documents nach Wahl über “Manage <’resource>’” , z.B. ist auch sowas

hidden tree rights

Für nicht autoriserte User sieht dann die Investigation/Related Item so aus:

related Items

Die “+” steht für “Hidden Items” – man sieht also, dass man nicht alles sieht.